Tunneliuunin ohjausjärjestelmä käyttää tyypillisesti tietokonejärjestelmää tai ohjelmoitavaa logiikkaa (PLC) täysin automatisoituun valvontaan. Järjestelmä mahdollistaa monivyöhykkeen, riippumattoman PID-lämpötilan säädön, joka varmistaa tasaisen ja vakaan lämpötilan uunissa.
Valvotut parametrit kattavat keskeiset prosessimuuttujat, kuten vyöhykkeen lämpötilat, kuljetinhihnan nopeuden, uunin sisäisen paineen ja korkean hyötysuhteen suodattimien paine-eron, ja järjestelmä sisältää hälytystoiminnot. Lisäksi nykyaikaiset ohjausjärjestelmät voivat integroida online-hiukkasvalvonnan, joka seuraa jatkuvasti ilmassa olevien hiukkasten määrää kriittisillä alueilla (kuten jäähdytysvyöhykkeellä) ja laukaisee hälytyksiä, jos rajat ylittyvät. Keskitetty valvonta ja tiedonhallinta useille uuniyksiköille voidaan saavuttaa tiedonsiirtomenetelmillä, kuten Ethernet.
